Pengawas YBPK-GKJW berfungsi sebagai penjaga keseimbangan dalam tata kelola yayasan. Mereka bertugas mengawasi pelaksanaan program yang dijalankan pengurus, menilai laporan kinerja, serta memastikan yayasan berjalan sesuai prinsip akuntabilitas dan transparansi. Kehadiran pengawas menjadi jaminan bahwa setiap langkah yayasan dapat dipertanggungjawabkan, baik secara administratif maupun secara moral dan rohani.
Selain menjalankan fungsi kontrol, pengawas juga memberi masukan yang konstruktif bagi pengurus dalam menyusun kebijakan. Dengan posisi yang strategis namun independen, pengawas memastikan YBPK-GKJW tetap fokus pada tujuan mulia sebagai lembaga pendidikan Kristen, sekaligus mampu beradaptasi dengan regulasi dan kebutuhan masyarakat yang terus berkembang.